英伟达 (NVIDIA®) 近期宣布,材料科学与生物分子学建模领域中四大领先的应用程序现已新增了对多 GPU 加速的支持,从而能够将模拟时间从数天缩短至数小时。这四款应用程序分别是 LAMMPSGROMACSGAMESS 以及 QMCPACK

  • 如此一来,科学家便能够以更高的精度和更长的时间周期来研究更大的分子模型,从而增进人们对药物潜在影响和新材料有效性的了解。  探索周期的缩短和成本的降低也可以让药物开发人员从中受益。
  • 除了这四款科学建模应用程序以外,现有的应用还包括AMBERNAMD 以及 TeraChem 它们所组成的阵营不断壮大,让大学、政府以及行业研究人员能够利用 GPU 的处理能力,从而推进研究进步。
  • 英伟达公司英伟达(NVIDIA®) Tesla事业部经理 Sumit Gupta 表示:“GPU 让低价、节能的超级计算实现了广泛普及,这将加速科学研究的步伐。  这种计算能力给科学界带来的好处是不可估量的,例如让研究人员能够在代价高昂且十分耗时的动物研究与病人试用之前,更快、更精确地模拟蛋白质与候选药物相互作用的生物学行为。”
  • 这四款被科学家广泛使用的应用程序利用超级计算来为各个关键领域推动建模的进步:
  • •       GAMESS 是一款量子化学应用程序,它在设计新药与新材料方面是非常重要的。  该应用程序利用计算方法来分析分子的电子结构和属性。
  • •       GROMACS 可模拟蛋白质与候选药物之间生物分子的相互作用。 它可以用来研究蛋白质的折叠与误折叠,这有助于研究人员了解老年痴呆症、亨汀顿氏舞蹈症以及某些癌症等疾病。
  • •       LAMMPS 可用来在原子级别上对软体 (生物分子、聚合物) 或固态 (金属、半导体) 材料进行建模。
  • •       QMCPACK 可模拟材料属性,利用连续量子蒙特卡洛法来实现高精度和绝佳的可扩展性。