田纳西大学已经获得计算机芯片制造商英特尔的资助开发计算机代码,实现个性化的医药和其他创新的科学发现。 

这些资金将用于田纳西大学和橡树岭国家实验室的联合计算机科学(JICS)研究所建立英特尔并行计算中心。并行计算,超级计算机中使用,是许多计算同时进行计算的一种形式。中心的重点将是超级计算机带入到一个新的水平,以满足科学计算需求。目前的研究受限于数据的大小、计算时间和计算所消耗的能源。 

该中心初期将专注于计算生物学中的两个项目,可能会推动医疗进步。 

“我们正在作出巨大的科学进步,但我们的计算机与大量数据的增长跟不上,”JICS主任和项目负责人Tony Mezzacappa说:“我们非常感谢英特尔能支持该中心,这使我们能够开发代码可以促进科学的进步和规划个性化医药和生物技术的未来。 ” 

第一个项目将使由Jeremy Smith领导的分子生物物理学研究小组来完成,他们将负责在下一代Intel机器上优化分子动力学代码GROMACS。 GROMACS主要是用来研究生化分子的相互作用,从而发明新的药物和研究代谢。 

“从2000年起GROMACS包已被超过一万多个发表的科学应用所使用。优化此代码,使其在下一代Intel的机器上使用,是使这些模拟更有效和更快地运行中的重要一步, ”史密斯说:“这让这些模拟更准确和细致,帮助我们理解我们周围的世界,让生活更好。 ” 

第二个项目将由JICS首席技术官 Glenn Brook和联合项目组领导,同时也是计算科学家 Bhanu Rekepalli一起完成,他们将优化基因序列分析代码BLAST,使其能在未来的计算平台上进行高效运作。 BLAST是基因组学和生物技术及个性化医学的未来的关键。 

“这是一个非常庞大的数据量,特别是在基因组学,我们现在研究得还很表面,,”Brook说: “优化关键代码,如BLAST为下一代Intel机器将使我们能够更快,更有效地解释数据。” 

“计算机也将改变我们做科学的方式,” Mezzacappa说:“例如,我们不需要执行多年的临床试验,我们可以通过计算的方式,将焦点集中在药物市场,以获得更快的速度和更低的成本。 ” 

该中心将继续使用东田纳西州优越的超级计算资源,包括JICS和世界上最快的超级计算机。 

“田纳西大学和其合作伙伴,橡树岭国家实验室,是全球超级计算机的中心,”校长Jimmy G. Cheek说:“世界各地的研究人员接进我们无与伦比的资源,像这样的合作让他们推到最前沿的发现。 ” 

英特尔并行计算中心本月初开始运作。还有其他四个英特尔并行计算中心设在美国普渡大学、奥斯汀得克萨斯大学的德州高级计算中心,德国足色柏林研究所, 和意大利大学的CINECA 。